甄某向物流公司隐瞒其与被害人的协议，要求物流公司虚开货运单，并先行垫付运费。物流公司将货物运至目的地后，被害人向物流公司支付全部运费才能拿到货物。被告人甄某通过上述方法实施诈骗10次，骗取5万元。